Bộ phim Tiểu Nữ Hoa Bất Khí là câu chuyện kể về cuộc đời lưu lạc đầy lâm li bi đát của thiếu nữ tên Hoa Bất Khí. Trải qua nhiều biến cố và thăng trầm, Hoa Bất Khí dần dần từng bước bị cuốn vào một cuộc chiến tranh chính trị tàn khốc. Hoa Bất Khí (Lâm Y Thần) được Mạc Nhược Phỉ nhận nuôi từ nhỏ, hắn dạy cô ăn xin, trộm cắp, lừa đảo… Trong một lần kết hôn giả với một tên ngốc để lừa tiền, Hoa Bất Khí và Mạc Nhược Phỉ cùng trốn chạy và rơi xuống vực sau đó xuyên không về thời cổ đại. Trong khi Mạc Nhược Phỉ xuyên không trở thành “Phú Nhị Đại”- công tử giàu sang phú quý thì Hoa Bất Khí lại phải tiếp tục kiếp ăn xin nghèo khổ, rách nát.

Sau 13 năm lưu lạc, giang hồ trùng phùng, Hoa Bất Khí được Mạc Nhược Phỉ đưa về làm quận chúa giả trong phủ Vương Gia. Thế giới mà bọn họ phải đối mặt lại đầy rẫy những hiểm ác, bị cuốn vào vòng xoáy dã tâm tranh quyền đoạt vị của 7 vị hoàng tử trong đó có Thái tử Trần Dực (Trương Bân Bân), người hận cô đến thấu xương nhưng cũng yêu cô điên dại. Sau này, Hoa Bất Khí và Trần Dực cùng nhau trải qua rất nhiều gian khổ, hiểm nguy, hết hận lại yêu, cùng nhau sát cánh chống lại rất nhiều thế lực ác bá khác. Để bảo vệ sự an toàn cho bản thân và sự bình yên cho lê dân bá tánh, Hoa Bất Khí đã phải vượt qua rất nhiều chông gai, dần dần trưởng thành, trở nên mạnh mẽ hơn bao giờ hết.