Đội Thiếu Niên Siêu Đẳng kể về câu chuyện của những người trẻ tuổi có siêu năng lực. Họ được tổ chức bí mật Moving tuyển dụng để sử dụng sức mạnh của mình cho mục đích tốt.

Nhân vật chính của phim là Kim Yo-han (Jo In-sung), một người đàn ông có khả năng điều khiển lực hấp dẫn. Anh ta từng là một vận động viên điền kinh xuất sắc, nhưng sau một tai nạn, anh ta đã mất đi khả năng của mình.

Yo-han gặp lại con gái của mình, Kim Ji-woo (Go A-ra), sau nhiều năm xa cách. Ji-woo cũng có khả năng điều khiển lực hấp dẫn. Yo-han quyết định giúp Ji-woo phát huy sức mạnh của mình và ngăn chặn tổ chức "Moving" sử dụng những người trẻ tuổi có siêu năng lực cho mục đích xấu.